PascaSarjana lahir seiring dengan berdiri UMT pada tahun 2009 dengan Surat Keputusan Menteri Pendidikan Nasonal No.109/D/0/2009, atas prakarsa tokoh-tokoh dan Pimpinan Daerah Muhammadiyah Tangerang Dr. H.Acmad Badawi dan kawan-kawan. Pada waktu itu sebelum tahun 2009 sudah Sekolah Tinggi Ilmu Ekonomi (STIE) Muhammadiyah Tangerang, Sekolah Tinggi Ilmu Kesehatan (STIKes) Muhammadiyah Tangerang, dan Sekolah Tinggi Agama Islam  (STAI) Muhammadiyah Tangerang. Diantara perguruan tinggi Muhammadiyah, UMT adalah universitas yang paling muda diantara Perguruan Tinggi Muhammadiyah yang ada di Indonesia, namun dalam perjalanannya sampai sekarang UMT telah mampu mengembangkan secara fisik dan non fisik, akademik dan non akademik.

Dilihat dari bangunan UMT telah mampu membangun kampus yang representatif dengan banngunan 12 lantai dan sedang dibangun lagi 19 lantai serta fasilitas-fasilitas lainnya. Dengan perjuangan fastabikul hkairat pada akhirnya UMT menjadi kampus pilihan dan perguruan tinggi alternative dari masyarakat Banten hususnya dan umumnya masyarakat DKI Jakarta, Bogor dan beberapa propinsi yang ada di Indonesia. 

Dalam usia 5 (lima) tahun, UMT saat ini telah memiliki 7 (tujuh) fakultas dengan 24 (dua puluh tiga) program studi dan program pascasarjana dengan 1 (satu) program studi, yaitu:

1) Fakultas Ekonomi 

a.      S.1 Akuntansi

b.      S.1 Manajemen

c.      D.3 Akuntansi

2) Fakultas Agama Islam

a.     S.1 Pendidikan Agama Islam

b.     S.1 Perbankan Syari’ah

c.      S.1 Pendidikan Bahasa Arab

3) Fakultas Kesehatan

a.      S.1 Ilmu Keperawatan

b.      D.III Kebidanan

c.      D.IV Bidan Pendidik

d.      Profesi Ners

4) Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan

a.      S.1 Pendidikan Matematika

b.      S.1 Pendidikan Bahasa Inggris

c.      S.1 Pendidikan Bahasa Indonesia

d.      S.1 PGSD

e.      S.1 PG-PAUD

5) Fakultas Teknik                  

a.      S.1 Teknik Informatika

b.      S.1 Teknik Elektro

c.      S.1 Teknik Sipil

d.      S.1 Teknik Mesin

e.      S.1 Teknik Industri

6) Fakultas Hukum

    S.1 Ilmu Hukum

7) Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Politik

a.      S.1 Ilmu Pemerintahan

b.      S.1 Ilmu Komunikasi 

8) Program Pascasarjana

    S.2 Magister Manajemen 

    S2. Magister Pendidikan Agama Islam (tahun 2017) 

Dengan semangat mutu yang tinggi tahun 2015 UMT sudah menyandang akreditasi Institusi B.   Dan sampai sekarang  tahun 2017 semua prodi hanya ada 3 prodi yang terakreditasi C, prodi yang lainnya sudah terakreditasi B